专利摘要显示，本申请涉及一种热能自适应循环燃料电池电堆结构，包括电堆本体以及设置于所述电堆本体一端的配气端;所述配气端的一端设置有第一冷却路进口和第二冷却路出口，所述配气端的另一端设置有第一冷却路出口和第二冷却路进口;所述电堆本体包括交替设置的第一双极板和第二双极板;所述第一冷却路进口通过所述第一双极板的第一冷却路流场与所述第一冷却路出口连通形成第一冷却路;所述第二冷却路进口通过所述第二双极板的第二冷却路流场与所述第二冷却路出口连通形成第二冷却路;所述第一冷却路的流动方向与所述第二冷却路的流动方向相反。本申请能实现电堆内部热能的自适应循环，有效均匀反应区的温差，提高电堆性能的一致性和寿命。